No estado da Bahia, desde outubro de 2015 até o dia 13 de fevereiro de 2016, foram notificados 744 casos de microcefalia. Os casos foram notificados em 121 municípios, por intermédio do Registro de Eventos em Saúde Pública (Resp). Desses casos, 161 foram investigados com a realização de exame de imagem, sendo 107 confirmados e 54 descartados.
Do total de casos notificados de microcefalia (744), 208 mães (27,9%) referiram ter tido doença exantemática na gestação. Dessas (208), 129 (62,0%) informaram que a doença exantemática ocorreu no primeiro trimestre, 45 (21,6%) no segundo trimestre, 13 (6,3%) no terceiro trimestre e 21 (10,1%) não lembravam.
A Bahia, a partir de definições e orientações do Ministério da Saúde, ajustou a definição de caso suspeito de recém-nascido à termo com microcefalia (perímetro cefálico menor do que 32 cm), passando a adotá-las para fins de vigilância epidemiológica.